Současně se stavbou bezbariérového podchodu probíhá na vlakovém nádraží i velká rekonstrukce zastřešení nástupišť. Zahájena byla na konci minulého týdne a kvůli tomu je až do poloviny srpna úplně uzavřeno páté nástupiště, které využívají vlaky ve směru na Velký Osek.

Uzavření nástupiště omezilo i jízdní řád. Spěšné vlaky linky R41 Vrchlice z Prahy přes Kolín do Kutné Hory a zpět, které jezdí ve špičkách pracovních dní, jsou až do poloviny prosince zkrácené a jezdí jen v úseku Praha – Kolín a zpět.

Spoje linky R42 Praha – Nymburk – Kolín a zpět, které jsou v provozu taktéž v pracovní dny, jsou až do 22. srpna ukončeny (resp. budou vyjíždět) ve stanici Velký Osek. Mezi Velkým Osekem a Kolínem je místo nich zajištěna náhradní autobusová doprava (linka XS2).

V úseku mezi Kolínem a Velkým Osekem až do 24. srpna nejezdí ani spěšné vlaky linky V41 z Kolína do Chlumce nad Cidlinou a dále do Trutnova, resp. naopak. Místo těchto vlaků též funguje náhradní autobusová doprava (linka XS2).